brain_information_flow_diagram
Brain Information Flow Diagram (BIF)
WBAIでは、全脳アーキテクチャを記述・共有するための形式としてinformation flow diagramの一種である Brain Information Flow Diagram (BIF) を提唱しています。
概要
BIFは大まかにいって、複数の Circuit とそれらの間の Connection からなります。
Circuit は、ニューロンの集団や脳内の海馬のような器官、さらには(一定の機能を果たすための)複数の脳器官からなる回路に対応します。
BIFオントロジー
BIFの要素は以下のようなクラスとプロパティを持つ オントロジー により定義されます。
Circuits and Connections are normally defined as classes rather than instances.
(BIFオントロジーのOWL形式ファイルはこちら)
Circuit
脳領域または脳器官の1つ以上の集まり
以下のプロパティを持ちます。
- names: 名前リスト
- hasPart: 包含する Circuit
- functionality: 機能の記述
- reference: 参照文献リスト
- implementation: URL(実装へのポインタ)のリスト
- uniform: 真理値(True iff 下位構造を持たず、唯一の出力を持つ)
- taxon: Taxon(動物種)(option/複数指定可)
UniformCircuit
下位構造を持たず、唯一の出力を持つ Circuit のサブクラス
- uniform: True
Circuit のプロパティの他、以下のプロパティを持ちます。
- size: 自然数(細胞数など)
- transmitter: 神経伝達物質
- modType: Excitatory, Inhibitory, Modulatory
Connection
Circuit 間の接続で、以下のプロパティを持ちます。
- inputCircuit: Circuit
- outputCircuit: Circuit
- transmitter: 神経伝達物質
- functionality: 機能の記述
- reference: 参照文献リスト
- size: 自然数(アクソン数など)
- taxon: Taxon(動物種)
NeuroTransmitter
神経伝達物質:ドーパミンなど
BIFデータの作成
BIFデータの作成についてはこちらを参照ください。
brain_information_flow_diagram.txt · 最終更新: 2020/06/06 10:20 by n.arakawa